Fenbendazol wird hauptsächlich zur Behandlung parasitärer Infektionen eingesetzt, darunter Spulwürmer, Hakenwürmer, Peitschenwürmer, Lungenwürmer sowie einige Bandwurmarten und Protozoen wie Giardia. Darüber hinaus kann Fenbendazol eine krebshemmende Wirkung haben, indem es die Mikrotubuli-Polymerisation in Krebszellen stört, was zum Zelltod (Apoptose) führt und den Stoffwechsel der Krebszellen beeinträchtigt.